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山东大学学报 (医学版) ›› 2020, Vol. 58 ›› Issue (4): 28-31.doi: 10.6040/j.issn.1671-7554.0.2020.295

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济南市47例新型冠状病毒肺炎患者取样部位对核酸检测结果的影响

赵怀龙,吕燕,赵红,赵宝添,韩莹,杨国樑,王春荣,关恒云,刘辉,刘岚铮   

  1. 济南市疾病预防控制中心, 山东 济南 250021
  • 发布日期:2022-09-27
  • 通讯作者: 刘岚铮. E-mail:jncdcllz@jn.shandong.cn
  • 基金资助:
    济南市新型冠状病毒肺炎防控专项

Effect of sampling positions in nucleic acid test on the test result: a report from 47 confirmed COVID-19 cases in Jinan City

ZHAO Huailong, LÜ Yan, ZHAO Hong, ZHAO Baotian, HAN Ying, YANG Guoliang, WANG Chunrong, GUAN Hengyun, LIU Hui, LIU Lanzheng   

  1. Jinan Center for Disease Control and Prevention, Jinan 250021, Shandong, China
  • Published:2022-09-27

摘要: 目的 探讨济南市新型冠状病毒肺炎患者取样部位对核酸检测结果的影响。 方法 选择2020年1月22日至2月11日经我中心确诊的47例新型冠状病毒肺炎患者的临床样本,应用实时荧光定量RT-PCR法进行检测,分析不同取样部位临床样本对检测结果的影响,采用Fisher精确概率法进行统计学分析。 结果 济南市共报告新型冠状病毒肺炎确诊患者47例,男23例,女24例,11个月~71岁,中位年龄35岁。鼻咽拭子样本新型冠状病毒核酸阳性率91.11%(41/45),痰液样本的核酸阳性率92.31%(13/14),两种样本检出率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,双侧P>0.999),但痰液样本的荧光RT-PCR检测Ct值明显低于对应的鼻咽拭子样本。 结论 鼻咽拭子样本能够满足新型冠状病毒感染筛查及确诊要求,深咳痰液样本可作为鼻咽拭子“假阴性”的有效补充。

关键词: 新型冠状病毒肺炎, 核酸检测, 实时荧光RT-PCR, 假阴性反应

Abstract: Objective To investigate the effect of sampling positions in nucleic acid test for COVID-19 on test results. Methods Clinical specimens collected from 47 confirmed cases of COVID-19 in Jinan City during Jan. 22 and Feb. 11, 2020 were tested with real-time fluorescence quantitative RT-PCR to analyze the effect of different sampling positions on the test results. Statistical analysis was conducted with Fisher’s exact test. Results The 47 patients included 23 males and 24 females, age ranging from 11 months to 71 years, average 35 years. The positive rate of nasopharyngeal swabs and sputum samples was 91.11%(41/45)and 92.31%(13/14), respectively. There was no statistical difference between the results of the two types of samples(Fishers exact test, bilateral P>0.999). However, the Ct value was lower in sputum samples than in nasopharyngeal swabs. Conclusion The nasopharyngeal swabs can meet the requirements for screening and diagnosis of COVID-19, and deep-coughed sputum samples can be used to re-test the “false negative” nasopharyngeal swabs.

Key words: COVID-19, Nucleic acid test, Real-time fluorescence quantitative RT-PCR, False negative reaction

中图分类号: 

  • R563.1
[1] Chen N, Zhou M, Dong X, et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study[J]. Lancet, 2020, 395(10223):507-513. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30211-7.
[2] Guan WJ, Ni ZY, Hu Y, et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China[J]. N Engl J Med, 2020, 28. doi: 10.1056/NEJMoa2002032.
[3] 国家卫生健康委员会. 截至3月28日24时新型冠状病毒肺炎疫情通报[EB/OL]. [2020-03-28]. http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqtb/list_gzbd.shtml.
[4] World Health Organization.Coronavirus disease(COVID-19)situation reports [EB/OL].[2020-03-28]. https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/situation-reports.
[5] Xu X, Chen P, Wang J, et al. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Sci China Life Sci, 2020, 63(3): 457-460. doi: 10.1007/s11427-020-1637-5.
[6] Li X, Zai J, Zhao Q, et al. Evolutionary history, potential intermediate animal host, and cross-species analyses of SARS-CoV-2[J]. J Med Virol,2020,27. doi: 10.1002/jmv.25731.
[7] 李士雪,单莹. 新型冠状病毒肺炎研究进展述评[J]. 山东大学学报(医学版), 2020, 58(3):19-25. LI Shixue, SHAN Ying. Latest research advances on novel coronavirus pneumonia[J]. Journal of Shandong University(Health Sciences), 2020, 58(3): 19-25.
[8] 国家卫生健康委员会.《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》. [EB/OL]. [2020-03-04]. http://www.nhc.gov.cn/xcs/zhengcwj/list_gzbd.shtml.
[9] 济南市卫生健康委员会. 新型冠状病毒肺炎疫情防控[EB/OL]. [2020-02-11]. http://jnmhc.jinan.gov.cn/col/col50366/index.html.
[10] 中华人民共和国国家卫生健康委员会办公厅. 新型冠状病毒实验室生物安全指南(第二版)[OB/OL].(2020-01-23)[2020-03-04]. http://www.nhc.gov.cn/xcs/zhengcwj/202001/0909555408d842a58828611dde2-e6a26.shtml.
[11] Corman VM, Landt O, Kaiser M. et al. Detection of 2019 novel coronavirus(2019-nCoV)by real-time RT-PCR[J]. Euro Surveill, 2020, 25(3). doi: 10.2807/1560-7917.
[12] 中华医学会.“全力抗击新型冠状病毒感染的肺炎疫情”方案指南与建议 [EB/OL].(2020-02-18)[2020-03-04]. https://www.cma.org.cn/art/2020/2/18/art_2928_32767.html.
[13] 里进, 叶光明, 陈良君, 等. 新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测假阴性结果原因分析及对策[J]. 中华检验医学杂志,2020,43. http://rs.yiigle.com/yufabiao/1181137.htm.
[14] 张瑞, 李金明. 如何减少新型冠状病毒核酸检测的“假阴性”[J]. 中华医学杂志, 2020. http://rs.yiigle.com/yufabiao/1182268.htm.
[15] Tian S, Hu N, Lou J, et al. Characteristics of COVID-19 infection in Beijing[J]. J Infect, 2020,26. doi: 10.1016/j.jinf.2020.02.018.
[16] 崔亮亮, 耿兴义, 赵小冬, 等. 济南市现阶段新型冠状病毒肺炎的流行特征与思考[J]. 山东大学学报(医学版),2020, 58(3): 52-57. CUI Liangliang, GENG Xingyi, ZHAO Xiaodong, et al. Reflection and epidemiological characteristics of coronavirus disease 2019 in Jinan City[J]. Journal of Shandong University(Health Sciences), 2020, 58(3): 52-57.
[17] 莫茜, 秦炜, 傅启华, 等. 正确认识新冠病毒核酸检测的影响因素[J]. 中华检验医学杂志,2020. http://rs.yiigle.com/yufabiao/1180120.html.
[1] 曹义海. 血管生成在疾病治疗中的应用与展望[J]. 山东大学学报 (医学版), 2021, 59(9): 9-14.
[2] 杨璇,李岩志,马伟,贾崇奇. 基于两样本孟德尔随机化的肺功能与新型冠状病毒肺炎病死风险的因果关系[J]. 山东大学学报 (医学版), 2021, 59(7): 104-111.
[3] 周溪,黄霂晗,任玉洁,邱洋. 新型冠状病毒感染与天然免疫及炎症反应[J]. 山东大学学报 (医学版), 2021, 59(5): 15-21.
[4] 于莹,张功,刘晶,颜世童,韩涛,黄海量. 基于网络药理学和分子对接方法探析黄芪预防新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制[J]. 山东大学学报 (医学版), 2021, 59(4): 6-16.
[5] 任敏敏,王广梅,张丽,杨瑶瑶,封丹珺. 335名抗疫一线护理人员心理弹性对共情疲劳的影响[J]. 山东大学学报 (医学版), 2021, 59(2): 88-94.
[6] 袁勇贵,李磊,沈仲夏,陈刚,吴义高,岳莹莹. 新型冠状病毒肺炎疫情下精神障碍诊疗的防控策略[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(4): 1-6.
[7] 常彩云,于秋燕,赵小冬,王芳,李伟,阮师漫,耿兴义. 济南市首例新型冠状病毒肺炎病例及其相关家庭聚集性疫情分析[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(4): 7-11.
[8] 杨丽,李战,刘晓雪,焦海涛,周林,刘庆皆,刘铁诚,耿兴义. 济南市新型冠状病毒肺炎密切接触者隔离医学观察情况分析与评价[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(4): 12-16.
[9] 乔宇,崔亮亮,李帅,王峰,阮师漫,景一鸣,刘翀. 智能问答机器人系统研发及应用研究——以济南市新型冠状病毒肺炎疫情处置应对为例[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(4): 17-22.
[10] 李新蕊,耿兴义,赵小冬,刘岚铮,王蔚茹,崔亮亮,李战,常彩云,阮师漫. 济南市47例新型冠状病毒肺炎疫情流行综合分析[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(4): 23-27.
[11] 山东大学齐鲁医院新型冠状病毒肺炎诊治专家组. 新型冠状病毒肺炎疑似病例诊断及管理专家共识·齐鲁医院标准[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(3): 1-7.
[12] 山东大学齐鲁医院新型冠状病毒肺炎防控工作组. 山东大学齐鲁医院新型冠状病毒肺炎防控策略与实践[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(3): 8-18.
[13] 李士雪,单莹. 新型冠状病毒肺炎研究进展述评[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(3): 19-25.
[14] 鞠秀丽. 间充质干细胞治疗新型冠状病毒肺炎的潜在机制和研究进展[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(3): 32-37.
[15] 周生余,王春亭,张伟,王锡明,董亮. 山东省新型冠状病毒肺炎患者537例临床特征与救治效果[J]. 山东大学学报 (医学版), 2020, 58(3): 44-51.
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