基因芯片技术筛选乳腺癌相关差异表达基因

山东大学学报(医学版) ›› 2011, Vol. 49 ›› Issue (7): 94-99.

基因芯片技术筛选乳腺癌相关差异表达基因

郭明明，余之刚，马忠兵，高德宗，李亮，李玉阳，张强，王峰，王斐，傅勤烨

山东大学第二医院乳腺外科，济南 250033

收稿日期:2011-03-03 出版日期:2011-07-10 发布日期:2011-07-10
通讯作者: 余之刚(1967- )，男，主任医师，博士生导师，主要从事乳腺疾病的基础与临床研究。 E-mail: yzg@medmail.com.cn
作者简介:郭明明（1984- ），女，硕士研究生,主要从事乳腺肿瘤的预防与治疗的研究。
基金资助:
山东省自然科学基金资助课题（Y2005C07）；山东省中青年科学家科研奖励基金资助课题(2007BS03028)。

Microarray-based gene expression profiles related to breast cancer

GUO Ming-ming， YU Zhi-gang， MA Zhong-bing， GAO De-zong， LI Liang， LI Yu-yang， ZHANG Qiang， WANG Feng， WANG Fei， FU Qin-ye

Department of Breast Surgery， The Second Hospital of Shandong University， Jinan 250033， China

Received:2011-03-03 Online:2011-07-10 Published:2011-07-10

摘要/Abstract

摘要：

目的分析并探讨乳腺癌与自身正常乳腺组织的差异表达基因。方法采用全人类基因组芯片检测技术，筛查3对乳腺癌及其自身正常乳腺组织的差异表达基因，并通过realtime PCR对部分差异表达基因进行验证。结果全基因组差异分析结果显示，乳腺癌及其自身正常乳腺组织间有427个差异表达基因，其中上调基因231个，下调基因196个。在这一组基因中，与细胞增殖有关的基因有27个（12个表达上调，15个表达下调），与细胞黏附有关的基因有15个（4个表达上调，11个表达下调），与细胞凋亡有关的基因有13个（6个表达上调，7个表达下调）。结论乳腺癌组织与自身正常乳腺组织在基因表达水平上存在较大差异，这些差异存在于不同生物学过程（如细胞增殖、细胞黏附、细胞凋亡等）中。

关键词: 乳腺肿瘤；基因芯片；差异表达基因

Abstract:

Objective To screen differently expressed genes between breast cancer tissues and corresponding normal breast tissues from the same patients. Methods Three pairs of breast cancer tissues and their corresponding normal breast tissues were screened for differently expressed genes by microarray. Then the result of microarray was verified by real-time PCR. Results There were 427 differently expressed genes between the two kinds of samples, (231 upregulated genes and 196 downregulated genes). Among these genes, 27 were related to cell proliferation (12 up-regulated and 15 down-regulated), 15 were related to cell adhesion (4 up-regulated and 11 down-regulated), and 13 were related to cell apoptosis (6 up-regulated and 7 down-regulated). Conclusion mRNA expression profiles in breast cancer tissues and corresponding normal breast tissues are very different, and the differential genes play important roles in cell adhesion, proliferation, and apoptosis.

Key words: Breast neoplasms; Microarray; Differently expressed genes

中图分类号:

R737.9

郭明明，余之刚，马忠兵，高德宗，李亮，李玉阳，张强，王峰，王斐，傅勤烨. 基因芯片技术筛选乳腺癌相关差异表达基因[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(7): 94-99.

GUO Ming-ming， YU Zhi-gang， MA Zhong-bing， GAO De-zong， LI Liang， LI Yu-yang， ZHANG Qiang， WANG Feng， WANG Fei， FU Qin-ye. Microarray-based gene expression profiles related to breast cancer[J]. JOURNAL OF SHANDONG UNIVERSITY (HEALTH SCIENCES), 2011, 49(7): 94-99.

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[1]	马振申1，王大伟2，孙秀彬3，史浩1，庞涛1，董桂青1，张成琪1. 3.0T磁共振对乳腺良恶性病变的定量分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(9): 79-83.
[2]	迟蔚蔚1，高海燕2，高海东3. 转化生长因子β1诱导的跨膜蛋白参与乳腺癌发展的分子机制[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(4): 26-29.
[3]	李珊珊，孙颖，丁涣，黎莉. β-catenin在不同亚型乳腺癌中的表达及其临床意义[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(3): 107-110.
[4]	岑东芝. NRIP3基因高表达抑制淋巴结阴性乳腺癌转移的研究[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(9): 83-.
[5]	王婧男1，郑燕2，肖东杰2，李金星1，丁卜同2，刘相东3，汪运山2，4. SATB1与HER2表达和乳腺癌分化程度的相关性[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(9): 91-.
[6]	张家鑫，马忠兵，于理想，刘丽媛，王斐，郭明明，王峰，余之刚. 血清脂联素、瘦素水平与乳腺癌相关性的初步研究[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(6): 110-.
[7]	万越，陈守华，顾禾，张丽丽. 硼替佐米联合表阿霉素对乳腺癌细胞增殖与凋亡的影响[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(2): 43-46.
[8]	杜金玲1，刘德祥1，陈文强2，江虹1，张茜1，潘芳1. 冠脉内支架置入患者术后应激反应及相关因素[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(2): 131-.
[9]	王新刚1，2，王笑峰3，李福年2，侯琳4，杨其峰1. 表观遗传学药物影响乳腺癌细胞系抑癌基因BRCA1及CHD5表达的研究[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(7): 29-34.
[10]	王泽筠1，徐成伟1，马晓丽2，郑燕2，郏雁飞2，肖东杰2，汪运山2. siRNA靶向抑制CPB2基因对乳腺癌细胞TAFI表达及生长和转移的影响[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(4): 57-.
[11]	杨华伟，刘剑仑，蒋奕，唐玮，韦薇，黄真. 赖氨酰氧化酶在乳腺癌中的表达及临床意义[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(4): 136-140.
[12]	王兴苗1，李孟圈1，王丽娟2，苏静1，胡荻1 . 乳腺浸润性导管癌中Caspase-3、OPN和Ezrin蛋白的表达及临床意义[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(4): 141-145.
[13]	郭鲁1，胡晓燕1，蒋雅丽1，徐同福1，王品2，李铭2，张莲英1. 真核表达载体pEGFP-N1-ZIP10的构建及其对人乳腺癌细胞中其他锌转运体基因表达的影响[J]. 山东大学学报(医学版), 2010, 48(11): 29-32.
[14]	徐月娟，邱少敏. 乳腺癌组织中c-erbB-2、ER和PR的表达及与预后的关系[J]. 山东大学学报(医学版), 2010, 48(9): 100-103.
[15]	刘云聪1，冉立2，谢飞3，谭诗生1，李杭1. Bcl-xl在乳腺癌中的表达及其临床病理相关性研究[J]. 山东大学学报(医学版), 2010, 48(9): 104-106.

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