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山东大学学报(医学版)

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血清蛋白质指纹图谱与人工神经网络模型在肺癌诊断中的应用

韩明勇1,刘奇1,余捷凯2,郑树2   

  1. 1. 山东大学附属省立医院肿瘤中心, 济南 250021; 2. 浙江大学肿瘤研究所, 杭州 310009
  • 收稿日期:2008-01-17 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-06-16 发布日期:2008-06-16
  • 通讯作者: 刘奇

Classification and diagnostic prediction of lung cancer using protein profiling of serum and bioinformatics

HAN Ming-yong1, LIU Qi1, YU Jie-kai2, ZHENG Shu2   

  1. 1. Cancer Center, Provincial Hospital Affiliated to Shandong University, Jinan 250021, China; 2. Institute of Cancer, Zhejiang University
  • Received:2008-01-17 Revised:1900-01-01 Online:2008-06-16 Published:2008-06-16
  • Contact: LIU Qi

摘要: 目的筛选肺癌相关标志物并建立诊断肺癌的蛋白质谱模型。方法应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测了86例肺癌、80例健康对照样本的血清蛋白质质谱,结合人工神经网络建立肺癌诊断模型。结果从肺癌组与健康对照组中筛选出了4个蛋白质荷比峰建立肺癌诊断模型,该诊断模型的特异性为 100%(95%的置信区间为93.9%~100.0%),敏感性为93.6%(87.6%~96.4%),准确率为96.7%(88.1%~98.3%)。结论成功建立了肺癌诊断模型,该模型在肺癌的诊断中具有较高的敏感性和特异性。

关键词: 蛋白组学, 生物信息学, 诊断, 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱, 肺肿瘤

Abstract: To identify serum biomarkers that distinguish lung cancer from healthy individuals by protein fingerprint pattern. Methods86 lung cancer patients and 80 healthy controls were determined by surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS). Results4 protein peaks were selected and used by artificial neural network (ANN) to establish a diagnostic model. The specificity of the diagnostic pattern was 100% and sensitivity of the pattern was 93.6%. ConclusionsA diagnostic model of lung cancer was successfully established, which has high sensitivity and specificity.

Key words: Lung neoplasms, Surface enhanced laser desorption/ionization timeofflight mass spectrometry, Bioinformatics, Diagnosis, Proteomics

中图分类号: 

  • R322.81
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