目的 用偏最小二乘路径模型(PLSPM)推断整体基因对多数量性状的交互作用。方法 通过数据模拟的方法评价基于PLSPM统计量的稳定性与检验效能,并对实例数据中的FTO和NEGR1两个基因进行分析,研究它们对相关多数量性状的交互作用。结果 统计模拟结果显示,基于PLSPM提出的检验统计量一类错误稳定,检验效能随着样本量的增加以及效应值的增大而升高。实例数据分析表明,基因区域FTO (Chr16:52390317.. 52391106)和NEGR1(Chr1:71707640..71709688)对相关多数量性状的交互作用有统计学意义(P=0039)。结论 对于两个整体基因对多数量性状的交互作用研究,提出的基于PLSPM统计量是一种有效的分析方法。