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山东大学学报(医学版) ›› 2012, Vol. 50 ›› Issue (9): 127-.

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肠道病毒71型基因组5′非编码区序列分析

袁晓晶1，温红玲1，高峰2，许洪芝1，司鲁莹1，王东旭1，
宋艳艳1，赵丽1，王志玉1   

  1. 1.山东大学公共卫生学院病毒学研究室 实验畸形学教育部重点实验室， 济南 250012；
    2.临沂市人民医院感染科， 山东 临沂 276000
  • 收稿日期:2012-04-25 出版日期:2012-09-10 发布日期:2012-09-10
  • 通讯作者: 温红玲(1977- )，女，副教授，主要从事分子病毒学和传染性疾病流行病学研究。 E-mail: wenhongling@sdu.edu.cn
  • 作者简介:袁晓晶(1986- )，女，硕士研究生，主要从事分子病毒学和传染性疾病流行病学研究
  • 基金资助:

    国家自然科学基金(30901265)；山东省自然科学基金(ZR2010CQ030)；教育部博士点基金新教师基金(20090131120068)；山东大学公共卫生学院青年人才创新基金(GGWS200801)。

Sequence analysis for 5′untranslated region of
genomes from enterovirus 71

YUAN Xiao-jing1,  WEN Hong-ling1, GAO Feng2, XU Hong-Zhi1, SI Lu-ying1,
WANG Dong-xu1, SONG Yan-yan1, ZHAO Li1, WANG Zhi-yu1   

  1. 1. Department of Virology, School of Public Health， Key Laboratory for Experimental Teratology of the Ministry of
     Education, Shandong University, Jinan 250012, China；
    2. Department of Infectious Diseases, Linyi People′s Hospital, Linyi 276000, Shandong, China
  • Received:2012-04-25 Online:2012-09-10 Published:2012-09-10

PDF (PC)

558

摘要：

目的   了解2009年山东省临沂市分离的肠道病毒71型(EV71)基因组5′非编码区(5′UTR)序列特征，探讨基因组中引起神经毒性作用的候选位点。方法   从手足口病患者的粪便标本中分离EV71，运用一步法逆转录聚合酶链反应扩增8个病毒株的5′UTR区，运用DNAstar 和MEGA 4软件进行序列分析。结果   8个病毒株5′UTR区核苷酸为741～745nt，核苷酸序列同源性介于97.0%～99.9%，8个病毒株的5′UTR区与C4亚型的同源性最高。序列比对发现，在5′UTR区第265nt及703nt处出现了核苷酸的突变(G265A,G703T)。遗传进化分析显示，8个病毒株序列与C4亚型的亲缘关系最为密切。结论   此8个病毒株为C4亚型，核苷酸突变(G265A,G703T)可能与EV71的致神经毒性作用有关。

关键词: 手足口病；肠道病毒71型；5′非编码区；遗传进化分析；神经毒性

Abstract:

Objective   To investigate the sequence of  5′ untranslated region (5′ UTR) in genomes from enterovirus 71 strains isolated in Linyi, Shandong province in 2009 and analyse the candidate locuses that were related to neurovirulence. Methods   8 EV71 strains were isolated from the patients′ feces samples.  5′UTR in genomes were amplified by RT-PCR and the sequences were analyzed by DNAstar and MEGA 4 softwares. Results   Lengths of 5′UTR for the 8 strains were in the range of 741-745 nt. Nucleotide sequence identities for 5′UTR were 97.0%-99.9%. The 5′UTR nucleotide sequences of 8 EV71 strains exhibited highest homology to the subtype C4 of EV71. Two mutations (G265A and G703T) in 5′UTR were found by nucleotide sequence analysis. The phylogenetic analysis based on 5′UTR showed that 8 EV71 strains had the closest genetic relationship with the representative strains of C4 subtype of EV71. Conclusion   The 8 EV71 strains belong to C4 subtype. Nucleotide mutations (G265A and G703T) might be relevant to neurovirulence of EV71.

Key words: Hand, foot and mouth disease; Enterovirus 71; 5′untranslated region; Phylogenetic analysis； Neurovirulence

中图分类号: 

  • R373.2
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[2] 王东旭1，温红玲1，董华1，孙成玺1，司鲁莹1，袁晓晶1，褚福禄1，赵丽1，王志玉1, 2. 不同免疫方案制备肠道病毒71型抗血清的免疫效果比较[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(3): 129-.
[3] 李志会，岳盈盈，宋楠楠，李鹏，孟红. 制备肠道病毒71型黏膜疫苗的初步探索[J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(2): 25-.
[4] 岳盈盈1，张颖2，李鹏1，李志会1，宋楠楠1，纪璇1，盖中涛2，孟红1. [J]. 山东大学学报(医学版), 2012, 50(2): 106-109.
[5] 李鹏1,张颖2,岳盈盈1,宋楠楠1,李志会1,盖中涛2,孟红1. 肠道病毒71型山东分离株全基因组序列分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2011, 49(10): 113-117.
[6] 李志会，李鹏，宋楠楠，岳盈盈，纪璇，赵元昊，孟红. 致敏绵羊红细胞在EV71细胞嗜性研究中的应用[J]. 山东大学学报(医学版), 2010, 48(11): 33-.
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