山东大学学报(医学版) ›› 2014, Vol. 52 ›› Issue (10): 55-60.doi: 10.6040/j.issn.1671-7554.0.2014.426
李丹, 李静宜, 董艳青, 任翊, 田秀君, 辛德莉
LI Dan, LI Jingyi, DONG Yanqing, REN Yi, TIAN Xiujun, XIN Deli
摘要: 目的 采用自行设计的引物,利用环介导等温扩增(LAMP)技术,建立一种快速检测急性呼吸道感染患儿咽拭子标本中肺炎支原体的方法。方法 针对肺炎支原体基因组内存在的重复序列SDC1设计6条特异性LAMP引物(SMP),使用实时浊度仪进行扩增反应并记录结果。对该方法进行灵敏度和特异性检测,并与文献报道的引物(JMP)进行比较。应用该方法和实时荧光定量PCR(Q-PCR)检测55例儿童咽拭子标本并对结果进行比较。结果 本研究中设计的肺炎支原体特异性SMP引物灵敏度高,最低检出肺炎支原体标准株FH的DNA拷贝数为6个。采用SMP引物的LAMP方法特异性好,与其他支原体和细菌间无交叉反应。55例临床标本分别使用SMP引物和JMP引物进行LAMP检测,两种方法的总符合率为98.2%;使用SMP引物的LAMP方法与Q-PCR的总符合率为96.4%。结论 采用本研究设计的SMP引物所建立的LAMP方法灵敏度更高,特异性好,较Q-PCR操作简便,耗时短,可用于临床儿童咽拭子标本中肺炎支原体的实验室快速检测,具有良好的临床应用前景。
中图分类号:
[1] Waites K B, Balish M F, Atkinson T P. New insights into the pathogenesis and detection of Mycoplasma pneumoniae infections[J]. Future Microbiol, 2008, 3(6): 635-648. [2] Ieven M, Ursi D, Van Bever H, et al. Detection of Mycoplasma pneumoniae by two polymerase chain reactions and role of M. pneumoniae in acute respiratory tract infections in pediatric patients[J]. J Infect Dis, 1996, 173(6): 1445-1452. [3] Welti M, Jaton K, Altwegg M, et al. Development of a multiplex real-time quantitative PCR assay to detect Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila and Mycoplasma pneumoniae in respiratory tract secretions[J]. Diagn Microbiol Infect Dis, 2003, 45(2): 85-95. [4] Sánchez-Vargas F M, Gómez-Duarte O G. Mycoplasma pneumoniae-an emerging extra-pulmonary pathogen[J]. Clin Microbiol Infect, 2008, 14(2): 105-117. [5] Ni X, McManus D P, Yan H, et al. Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) assay for the identification of Echinococcus multilocularis infections in canine definitive hosts[J]. Parasit Vectors, 2014, 7(1): 254. [6] Fallahi S, Seyyed Tabaei S J, Pournia Y, et al. Comparison of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and nested-PCR assay targeting the RE and B1 gene for detection of Toxoplasma gondii in blood samples of children with leukaemia[J]. Diagn Microbiol Infect Dis, 2014, 79(3): 347-354. [7] Dhama K, Karthik K, Chakraborty S, et al. Loop-mediated isothermal amplification of DNA (LAMP): a new diagnostic tool lights the world of diagnosis of animal and human pathogens: a review[J]. Pak J Biol Sci, 2014, 17(2): 151-166. [8] Zhou D, Guo J, Xu L, et al. Establishment and application of a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) system for detection of cry1Ac transgenic sugarcane[J]. Sci Rep, 2014, 4: 4912. [9] 何旭峰, 彭焕, 丁中, 等. 植物罹病组织中象耳豆根结线虫的LAMP快速检测方法[J]. 中国农业科学, 2013, 46(3):534-544. HE Xufeng, PENG Huan, DING Zhong, et al. Loop-mediated isothermal amplification assay for rapid diagnosis of meloidogyne enterolobii directly from infected plants[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2013, 46(3):534-544. [10] Gotoh K, Nishimura N, Ohshima Y, et al. Detection of Mycoplasma pneumoniae by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay and serology in pediatric community-acquired pneumonia[J]. J Infect Chemother, 2012, 18(5): 662-667. [11] 侯安存, 刘玉华, 辛德莉, 等. 健康儿童鼻咽部常见致病微生物携带状况及临床意义[J]. 中华儿科杂志, 2002, 40(1):45-49. HOU Ancun, LIU Yuhua, XIN Deli, et al. Nasopharyngeal carriage status of common pathogenic microorganisms in healthy children and its clinical significance[J]. Chin J Pediatr, 2002, 40(1): 45-49. [12] 胡亚美, 江载芳, 诸福棠. 实用儿科学[M]. 7版.北京:人民卫生出版社, 2002: 1204-1205. [13] 黄庆华, 叶嗣颖, 陈桂蓝. 不同临床样品肺炎支原体的分离培养[J]. 临床检验杂志, 1998, 16(04): 51-52. [14] 赵茹, 黄莉, 季伟. 双份血清MP抗体及痰MP-PCR检测在儿童肺炎支原体感染诊断中的价值[J]. 江苏医药, 2008, 34(12): 1282-1283. [15] Welti M, Jaton K, Altwegg M, et al. Development of a multiplex real-time quantitative PCR assay to detect Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila and Mycoplasma pneumoniae in respiratory tract secretions[J]. Diagn Microbiol Infect Dis, 2003, 45(2): 85-95. [16] Kenri T, Taniguchi R, Sasaki Y, et al. Identification of a new variable sequence in the P1 cytadhesin gene of Mycoplasma pneumoniae: evidence for the generation of antigenic variation by DNA recombination between repetitive sequences[J]. Infect Immun, 1999, 67(9): 4557-4562. |
[1] | 朱建雷,刘金同,王旸,王端卫,朱晓萌,张珊静,朱建伟. 枣庄市农村留守儿童主观生活质量与自我意识现状[J]. 山东大学学报(医学版), 2017, 55(9): 128-132. |
[2] | 徐加龙,孙小刚,王军锋,刘倩,马楠,李殿国,陈维秀,李金良,王若义. 经腹腔镜手术与开放手术治疗原发性膀胱憩室临床效果比较[J]. 山东大学学报(医学版), 2017, 55(7): 95-99. |
[3] | 张杰, 王志刚, 王益华, 姜彬, 何伟, 殷鑫, 郭文强. 儿童颅内动静脉畸形出血的临床特点及治疗分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2015, 53(2): 56-60. |
[4] | 刘贞艳, 胡彬, 毕振旺, 寇增强, 房明, 陈保立, 任艳艳, 毕振强. 2013年山东省四地市儿童A群链球菌耐药特征及其表型、基因型分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2015, 53(1): 77-80. |
[5] | 郭彬, 汪心海, 徐凌忠, 盖若琰. 山东省农村学龄前儿童心理健康状况及影响因素[J]. 山东大学学报(医学版), 2015, 53(1): 87-92. |
[6] | 许月芳, 刘皈阳, 张鑫. 氨曲南治疗下呼吸道感染疗效及 安全性的Meta分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(Z2): 198-200. |
[7] | 吴宏图, 丁娴, 张磊, 曹兴丽, 王峥艳, 单春明, 刘平. 儿童咳嗽变异性哮喘FeNO、hs-CRP及 IgE水平变化及意义[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(S2): 82-83. |
[8] | 陶丹, 许江涛, 肖亦爽. 86例儿童眼球穿通伤临床分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(S1): 90-91. |
[9] | 余炳贤. 2014年香格里拉县幼儿园0~6岁儿童体检结果分析及防治[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(S1): 109-109. |
[10] | 徐翠, 王涛, 周平. 儿童幽门螺杆菌免疫组化染色检测分析[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(9): 81-84. |
[11] | 高雯, 曹枫林, 崔乃雪. 医学生儿童期创伤与成年早期执行功能、负性情绪[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(9): 95-98. |
[12] | 尚念胜, 霍然, 吕仁荣, 徐广琪, 赵冉. 负压辅助闭合技术在儿童损毁性创面中的临床应用[J]. 山东大学学报(医学版), 2014, 52(7): 102-105. |
[13] | 王妍1,杨丽敏1,2,孙萌萌2,崔开艳2,杨晓东2,乔冬冬1,2,王汝展2,张敬悬2,刘兰芬1,2. 儿童期虐待与精神分裂症患者人格特征的相关性[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(8): 103-106. |
[14] | 李婧,李保敏,雷革非,贾桂娟,童丽丽,王纪文. 儿童良性癫痫伴中央颞区棘波的不典型表现[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(7): 42-44. |
[15] | 孙瑾,韩波,魏美丽,杨文巍,王介忠,刘永蛟. 动脉导管未闭患儿TFAP2B基因变异筛查[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(3): 72-75. |
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