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山东大学学报(医学版)

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肾癌及癌旁组织蛋白质组学的比较研究

靖永胜1,刘师莲1,张旭华1,吴晓青2,杨银荣1,王伟1   

  1. 山东大学 1. 医学院生物化学与分子生物学研究所;2. 济南市中心医院肿瘤中心, 山东 济南 250012
  • 收稿日期:2006-12-12 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-08-24 发布日期:2007-08-24
  • 通讯作者: 刘师莲

Proteomic analysis of renal cancer cells and kidney control tissues

JING Yong-sheng1,LIU Shi-lian1,ZHANG Xu-hua1,WU Xiao-qing2,YANG Yin-rong1,WANG Wei1   

  1. 1.Institute of Biochemistry and Molecular Biology;2.Tumor Center, Jinan Central Hospital,Shandong University
  • Received:2006-12-12 Revised:1900-01-01 Online:2007-08-24 Published:2007-08-24
  • Contact: LIU Shi-lian

摘要: 目的:建立肾癌及癌旁组织比较蛋白质组学双向电泳技术研究体系。方法:取病理证实的肾癌及癌旁组织,研磨、超声裂解、抽提蛋白,采用双向凝胶电泳分离,进行染色,Image Master 2D Platinum软件分析、识别差异表达蛋白质,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱得到相应肽质量指纹图谱,搜索数据库鉴定部分差异蛋白质点。结果:从双向电泳图谱上获得蛋白质斑点:肾癌组织(1326±78)个,癌旁组织(1232±56)个。显著差异蛋白质点46个,对其中7个点进行了筛选鉴定。结论:分析这些差异蛋白有助于寻找具有普遍性意义的肾癌标志物,进而为肾癌的早期诊断和防治提供理论和实验依据。

Abstract: Objective: To establish two-dimensional electrophoresis profiles with high resolution and reproducibility from renal cell carcinoma (RCC) tissues and paired tumoradjacent kidney tissues and to identify the differential expression proteins. Method: The total proteins of RCC tissues determined by histological and paired tumoradjacent kidney tissues were separated by two-dimensional gel electrophoresis(2-DE), analyzed by Image Master 2D software, and identified by peptide mass fingerprint(PMF) and database searching. Result: Well-resolved, reproducible 2-D maps of the above tissues were obtained. Some of the different proteins identified by mass spectrometry(MS) were matched in the SWISS-2DPAGE database. Conclusion: These data will be valuable for studying the diagnostic markers, mechanisms of metastasize and therapeutic targets.

Key words: Spectrum analysis, mass, Proteomics, Electrophoresis, gel, two-dimensional, Kidney neoplasms

中图分类号: 

  • R737.11
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